Trung tâm Phân tích ADN và Công nghệ di truyền chính thức được thành lập từ năm 2004 theo quyết định của Liên hiệp các Hội Khoa học kĩ thuật Việt Nam và giấy phép hoạt động của Bộ Khoa học và Công nghệ. Trước đó 10 năm, nhóm các nhà khoa học tại Đại học Quốc gia Hà Nội, đứng đầu là GS. Lê Đình Lương, đã tiến hành nhiều công trình nghiên cứu và thử nghiệm trên thực tế công nghệ ADN để xác định đặc trưng cá thể ở người Việt Nam. Để hoàn thiện công nghệ, Trung tâm đã tiến hành hàng nghìn thí nghiệm, đặc biệt đã xác định được tần số alen của nhiều gen đa hình ở người Việt với số lượng mẫu rất cao cho mỗi gen. Kết quả đã được công bố trên các tạp chí chuyên ngành và báo cáo tại Hội thảo quốc tế về giám định ADN, thành phố Orlando, tiểu bang Florida, Hoa Kì, tháng 5 năm 2012. Do vậy, độ chính xác của mỗi thí nghiệm đã đạt trên 99,9999% cho các kết luận khẳng định quan hệ huyết thống.

Cũng như các công nghệ cao khác, công nghệ ADN đang phát triển với tốc độ bùng nổ. Trong công nghệ này, nếu dừng lại là tụt hậu. Nhận thức từ thực tế đó, Trung tâm luôn quan tâm nâng cao trình độ và phát triển đội ngũ khoa học, nâng cấp nhanh chóng và kịp thời các trang thiết bị hiện đại.

Cho đến nay, Trung tâm Phân tích ADN và Công nghệ di truyền đã xác định quan hệ huyết thống cho hàng vạn trường hợp bao gồm những cá nhân có yêu cầu ở trong và ngoài nước, các tòa án, các sứ quán. Ngoài ra, để đáp ứng nhu cầu cấp bách của xã hội, Trung tâm mở thêm dịch vụ giám định ADN hài cốt. Sự khác biệt ở đây so với các nơi khác ở Việt Nam là ngoài các gen ti thể, Trung tâm cũng triển khai giám định cả các gen trong nhân tế bào như các nước tiên tiến trên thế giới đang làm, nên đạt độ chính xác cao hơn và thời gian giám định nhanh hơn.

Ngoài những thành tựu nghiên cứu ứng dụng đã đạt được, Trung tâm còn tự hào đã đào tạo nhiều kĩ thuật viên chuyên ngành cho các cơ quan hình sự và pháp y đầu ngành về giám định ADN ở nước ta.